膜渗析的动力是浓度差。只要膜的两边存在浓度差,分离和扩散便能进行。选择孔径大小适当的平面膜,将要分离的物质置于分配室中,分析物中的某种成份便能透过膜而扩散到接受室中,而其它的成分却不能,从而达到分离和浓缩的目的。
一般说来,单位时间内透过膜的分子数主要是由:浓度梯度;膜的参数决定。而膜的参数主要由:膜的表面积和厚度、由样品的流速所决定的分析物的扩散因子、操作时的温度、分析物分子和膜的孔径的大小所决定。因此要使分析物的回收率较高,就必须选择好膜及控制好操作条件。一般的做法为:减少膜的厚度及分配孔道的深度以增加回收率(现在最主要的在线渗析膜是GILSON膜)。也可以用空的纤维膜代替平面膜,以增加其表面积。典型的做法是:将维管束两端固定,中间浸入在液体中。这样,相当于使接受室在纤维中。但使用该方法存在的问题是:用纤维膜较难洗涤,且纤维膜较脆,还需大量的样品。由于各种膜所具有的孔径大小不同。因此,它能将分子大小不同的物质分离。在对物质分离之前,要选择好膜的孔径大小,使其能较高的将所要的物质分离,且快速将分子转移。通常膜为10~15KDA便足够用于一般样品的制备。